明朝末年,皇帝昏庸,曾保家卫国屡建功勋的锦衣当飞船里到处都在响起警告,当飞船的大门缓缓合上,当大部分怪鸟都分了出去,只剩下五只被关在大厅里的时候,夏草和樱桃都松了口气,以为这下安全了,当感觉到飞船在升空,她们也觉得这是明智之举。卫被旰佞利用,沦为暗杀工具,令世人闻风丧胆。因谋权篡位而被施以刖刑的庆亲王(洪金宝 饰)虽被流放塞北多年,然野心不死,暗中勾结大太监贾精忠(罗家英 饰),企图卷土重来。贾精忠在中土掀起一场腥风血雨,不愿苟从者格杀勿论。锦衣卫指挥史青龙(甄子丹 饰)在执行任务过程中因发现贾精忠阴谋而被追杀,身受重创后委身正义镖局以图保护玉玺。茫茫大漠,青龙在镖头之女乔花(赵薇 饰)以及天鹰帮帮主大漠判官(吴尊 饰)的帮助下准备阻止庆亲王与贾精忠的阴谋,此时,庆亲王义女——拥有绝世武功的脫脫(徐子珊 饰)身负追杀青龙的使命亦赶至雁门关……